MainBrain adviseert middelgrote en grote ondernemingen en organisaties bij het overstappen naar Open Source software. Hierbij ligt de nadruk op het geven van inzicht aan het management en de ICT-afdeling over de waarde van Open Source voor de onderneming / organisatie. Verder biedt MainBrain inhoudelijke technische ondersteuning onder andere door het schrijven van applicaties op maat. Speciale aandacht gaat uit naar Open Source projecten binnen het onderwijs, de zorg, de telecom en de overheid.